Kuromukuro ซากศพสีดำ ระหว่างการสร้างเขื่อนคุโรเบะ มีการค้นพบ Artifact เก่าแก่ ทำให้มีการก่อตั้งสถาบันวิจัยคุโรเบะขึ้นมา โดยจะรวบรวมนักวิจัยหัวกระทิมาเพื่อศึกษา Artifact รวมถึงมีการก่อตั้งโรงเรียนเพื่อให้ลูกของนักวิจัยเหล่านั้นเข้ามาเรียน และยูกิเนะก็นับเป็นนักเรียนหนึ่งในนั้น วันหนึ่งเกิดเหตุการณ์ประหลาด ทำให้ยูกิเนะพบกับเคนโนสุเกะ ซามูไรยุคเก่า วันคืนอันไม่ปกติของหนุ่มซามูไรกับยูกิเนะได้เริ่มขึ้นแล้ว