“Hundred” อาวุธเพียงหนึ่งเดียวที่สามารถต่อต้านสิ่งมีชีวิตปริศนา “Savage” ที่เข้ามารุกรานโลก โดย Slayer คือชื่อของผู้ใช้อาวุธ Hundred “Hayato Kisaragi” ผู้ที่สมัครเข้าเป็นนักเรียนในโรงเรียนที่อยู่ในเมืองกลางทะเลที่ชื่อว่า “Little Garden” และได้พบกับ “Emil Crossford” เพื่อนร่วมห้องที่เหมือนจะรู้จักเขามาก่อนและเขาก็เหมือนรู้จัก Emil มาก่อนเช่นกัน และเมื่อเขาเข้ามาโรงเรียนไม่ทันไรก็ถูกท้าดวลโดย “Queen” Slayer ผู้แข็งแกร่งนาม “Claire Harvey” และนี่คือจุดเริ่มต้นของเรื่องราวทั้งหมด